几乎所有的药物都可以通过胎盘进入胎儿体内，其中，分子量越小的越容易通过，脂溶性高与离子化程度低的药物也较容易通过。药物与蛋白结合能力的高低与通过胎盘的量成反比。药物对胎儿的不良影响包括药物本身的性质、药物剂量、用药持续时间、胎儿对药物的亲和性以及用药时的胎龄。多数药物对胚胎作用的关键期在妊娠的第3～8周，即器官分化期。心脏于妊娠20～40天对药物作用最敏感，肢体大约在第24～46天最敏感。因为有些器官几乎同时发育，所以有时一种药物会同时造成多器官畸形。

妊娠期间大剂量使用四环素类药物，可引起胎儿牙釉质发育不全。根据用药早晚不同，分别影响乳齿和恒齿的牙釉质发育。妊娠期间大剂量或长期反复使用氨基糖苷类药物，如链霉素、卡那霉素等，可损害胎儿第8对脑神经，出现先天性耳聋。新生霉素能抑制葡萄糖醛酸酶活性，引起胎儿高胆红素血症。抗结核药利福平能诱发大鼠、小鼠发生脊柱裂、腭裂等畸形。也有研究发现，在妊娠期间使用异烟肼、对氨基水杨酸等抗结核药的孕妇所生新生儿中，发生畸形的机会比未用药者高一倍。

大多数研究认为，癫痫妇女用抗癫痫药者，其婴儿畸形率较正常妇女高7～8倍，比癫痫妇女未用药者高2～3倍。致畸可能是药物本身或其代谢产物、或孕妇抽搐引起缺氧、叶酸缺乏及遗传因素共同作用的结果。如丙戊酸盐、苯妥英钠等致畸风险较高，建议癫痫妇女在专科医生指导下用药。

如果在妊娠早期，特别是治疗先兆流产和习惯性流产时，大剂量或长期使用性激素（特别是黄体酮、炔诺酮等药物），可干扰胚胎生殖系统的正常分化，导致生殖系统畸形，使女性胎儿外生殖器男性化。因为一般临床上用于保胎的孕激素多为合成激素，合成孕激素类药物具有一定程度的雄激素样作用。用天然孕酮保胎则未见畸形儿出生。雌激素能导致脑积水、脑膜膨出、内脏畸形等。孕妇在妊娠早期用己烯雌酚后，会对胎儿产生迟发性不良反应，所育女婴在幼儿期可引起乳腺增大，青春期后可发生生殖器的多发疾病或畸形，发生高峰在9岁左右，己烯雌酚对男性胎儿也似有影响，可导致附睾囊肿、睾丸发育不全、隐睾、精液异常等。

口服长效避孕药（如：醋酸曲普瑞林）者，应该在停药半年后再怀孕，现已不主张服用长效避免药；长期口服短效避孕药（如：去氧孕烯炔雌醇片、复方醋酸环丙孕酮片）者，应该在停药3个月后再怀孕比较安全。

抗肿瘤类药物多数有细胞毒作用，能阻止细胞DNA、RNA及蛋白质的合成，因此，大多数抗肿瘤药物都有一定的致畸作用，可引起多种畸形。烷化剂中5-氟尿嘧啶、苯丁酸氮芥、环磷酰胺等对人类可产生死胎、流产和畸形。甲氨蝶呤可以对抗四氢叶酸，为较强的致畸剂。

对必须用抗凝剂的孕妇最好用肝素，而不用香豆素类药物。因为香豆素衍生物能顺利通过胎盘，不论妊娠时期早晚，均会对胎儿造成危害，有较强的致畸作用。而肝素分子量大，表面负电荷多，不易通过胎盘。

抗甲状腺类药物甲苯磺丁脲和氯丙脲、磺酰脲均能引起胎儿无脑、无眼等多发畸形。妊娠中期，孕妇长期使用亚碘酸盐、碘化钾等含碘药物，可引起胎儿甲状腺肿。妊娠2个月后应用治疗量的放射性碘或硫氧嘧啶等抗甲状腺药，可使胎儿甲状腺滤泡萎缩退化，抗甲状腺药物能抑制胎儿甲状腺的合成，致婴儿甲状腺功能低下，而甲状腺素不足，可使胎儿自身脑垂体分泌促甲状腺素增加，引起胎儿甲状腺代偿性增生。

阿司匹林是一种致突变剂，能引起人体细胞染色体产生断裂片段、双着丝点和环状染色体。同时，阿司匹林也是一种致畸剂，大剂量的阿司匹林与死胎、死产、新生儿低体重有明显关系。妊娠10周之内不建议服用。孕后期有凝血功能障碍、妊娠高血压疾病者可在医生指导下服用。

苯丙胺是中枢兴奋药及抗抑郁药，因能抑制食欲而有减肥作用，曾被一些妊娠妇女用来控制过快增长的体重，结果这些妇女所生婴儿发生先天畸形（如：唇裂、心脏及大血管畸形）的人数明显增多，因此，孕妇慎用。

抗过敏药物中，有些药物对孕妇无不良影响，可放心使用，如葡萄糖酸钙一般对孕妇及胎儿均无不良影响，且对过敏所致的皮肤瘙痒有较好疗效。但是，哌嗪类H ₁受体阻断药，如氯苯甲嗪，是一类抗组胺药，对动物有致畸作用，孕妇最好不要使用。